激活态的持续时间分布 | / | 图2a | 主要时图2a,少部分情况下为峰值不为0的单峰分布,但是也接近图2a | 图2a | 主要时图2a,少部分情况下为峰值不为0的单峰分布,但是也接近图2a |
沉默态的持续时间分布 | / | 图2c | 图2c | 图2b,图2c | 图2b,图2c |
mRNA数量分布 | 图2e | 图2d至图2f | 图2d至图2g | 图2d至图2g | 图2d至图2g |
保 留 信 息 | 细胞群体水平的平均mRNA信息 |
mRNA的噪声强度、爆发频率和大小、激活态和沉默态的平均持续时间 |
| | mRNA分布性质 |
| | 激活态持续时间分布 | 沉默态持续时间分布 | 激活态和沉默态的 持续时间分布 |
精确度 | 低 | 中等 | 较高 | 较高 | 高 |
参数 | 很少,可由实验测得 | 少,可由实验测得 | 中等,部分可由实验测得,部分需要假设且要与实验相符 | 中等,部分可由实验测得,部分需要假设且要与实验相符 | 多,主要步骤可由实验测得,部分未明确的机制需要假设 |
计算量 | 很小 | 小 | 中等 | 中等 | 大 |
适用情况 | mRNA或蛋白质的CV较小,不考虑单细胞中mRNA的时变 | 研究单细胞转录产物数量变化,基因状态切换以及转录调控等 | mRNA数量呈多峰分布、激活态时长呈单峰分布,或者研究转录调控和信号传导时采用多ON态模型 。在研究相分离对转录的影响时可用连续性模型,侧重于转录因子或者聚合酶的局部时空变化对转录的影响 | 研究周期性和能耗时,可采用棘轮模型。研究温度、启动子序列、转录因子等对转录的影响时用多尺度,侧重于脚手架结构对转录的影响 | 研究转录因子自身生物功能对转录过程的影响 |